乳糖不耐受主要因乳糖酶缺乏引起，其中先天性乳糖酶缺乏与遗传、种族等因素有关，继发性乳糖酶缺乏由肠炎引起，年龄增长可导致乳糖酶活性下降，导致乳糖不耐受。
　　一、先天性乳糖酶缺乏、活性不足
　　先天性乳糖酶缺乏、活性不足多发生于新生儿中，其发生与遗传、种族有关。由于乳糖酶缺乏及活性不足程度各不相同，其症状也不同。
　　二、继发性乳糖酶缺乏
　　肠炎可导致肠绒毛顶端受损，导致乳糖酶缺乏。许多早产儿、新生儿由于肠黏膜发育不成熟，出现暂时性乳糖不耐受。
　　三、成人型乳糖酶缺乏
　　随年龄增长，人体内乳糖酶活性逐渐下降，可引起乳糖不耐受。其发生率与种族有关，黄种人与黑人比白人发生率高。