卵巢巧克力囊肿有可能会影响女性月经的。如果卵巢巧克力囊肿比较小，对月经的影响则不明显；如果是比较大的囊肿，则会对卵巢组织破坏的比较多，就会表现为月经的异常，临床上通常会引起月经量特别多。它会影响女性的卵巢功能，由于部分女性会表现为经期延长，而且女性卵巢功能受到影响会影响女性的排卵，甚至引起月经经期的延长。在临床上，对于卵巢巧克力囊肿这样的患者，应该定期进行超声检查，以排除巧克力囊肿迅速的长大，必要时则需要进行手术治疗。

卵巢巧克力囊肿的患者在术后应该注意以下事情，首先要预防复发，多卧床休息，预防感染，积极的补充营养。因为巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，具有非常高的复发率，因此患者在术后需要坚持服用药物来控制病情，这样可以有效的预防复发。另外，为了让患者的身体尽早的恢复健康，需要让患者卧床一段时间，多吃蔬菜水果，补充足够的蛋白质。最后，患者需要定期的做好手术窗口的卫生护理，这样可以避免感染加快病症的恢复。在术后三个月以内，患者不可以进行性生活，必须在确认身体完全恢复到术前状态时，才能够进行适当的性生活。

目前对于巧克力囊肿的确诊，首先要做妇科超声检查，因为卵巢巧克力囊肿和其他的囊肿有点不一样。卵巢巧克力囊肿的超声下的回声不是太均匀，因为里面包绕着像“巧克力状的东西”比较粘稠，而且巧克力囊肿的囊壁较厚，还会和周围形成粘连，所以应该做超声检查，必要时也可以做核磁共振和ct检查，但是对于巧克力囊肿的金诊标的诊断一定是腹腔镜。腹腔镜也相当于一个手术，在临床上除了做影像学的检查，还可以进行抽血检查。抽血查肿瘤标记C125，如果c125增高，考虑有可能是子宫内膜异位症，可能是巧克力囊肿。

当巧克力囊肿没有得到一定的治疗发生越来越大的情况下很容易出现巧克力囊肿破裂的情况，如果巧克力囊肿出现了破裂严重的时候有可能会致命危险，因为巧克力囊肿的囊液有很大的侵蚀性。巧克力囊肿目前来说，一般医生大多数都是推荐治疗的，当然也有一些人对治疗无论是药物手术都有恐惧，当然也有一些比较偏远的地方或者经济比较差的一些家庭，不能承受选择了不治疗。当然其实不治疗，如果没有症状，只是慢慢的发展、慢慢长、发生恶变的概率也是比较低，主要是巧克力囊肿增大还有引起的一个周围的炎症反应，机能粘连引起一个慢性的疼痛、不孕这一些情况，当然到后期来说有可能就是不能手术，只能用药物治疗了。巧克力囊肿大多生长在女性朋友的卵巢当中，当得了巧克力囊肿就代表卵巢出现一定的问题。大家都知道女人怀孕是和卵巢有很大的关系的，所以得了巧克力囊肿就一定会影响卵巢的正常功能，从而影响怀孕的。针对于没有生育过的女性朋友来说这是非常严重的问题，所以在没有生过孩子又有生育要求的人来说如果巧克力囊肿不治疗就会容易不孕。另外巧克力囊肿虽然是良性疾病很少发生恶变。但是却有增生、破裂、浸润、转移及复发等恶性行为。

多次人工流产就特别容易导致巧克力囊肿疾病出现，女性朋友日常生活里面没有做好避孕措施，就会意外怀孕，如果反复人工流产，那么在进行流产手术的时候，子宫的压力就会发生改变，会导致子宫内膜碎片进入到盆腔，巧克力囊肿就会出现。现在的人思想比较开放，所以性生活也比较紊乱，如果女性在性生活的时候没有注意卫生，像是在月经期间进行性生活，就特别容易让月经血进入到盆腔，导致巧克力囊肿发生，女性朋友一定要小心，在月经期间一定不要进行性生活，在平时也应该注意双方的生殖器官清洁。出现巧克力囊肿还有可能是因为免疫功能受到损害，女性的卵巢部位如果免疫能力不足够，盆腔里面的子宫内膜碎片没有办法及时排出体外，这个时候卵巢的部位就会生长，会造成巧克力囊肿问题出现。