一夜之间咽喉吞咽疼痛的原因有：急性咽炎、急性扁桃体炎、急性会厌炎。

1、急性咽炎

由细菌和病毒感染引起的急性咽炎往往发病迅速，进展迅速。患者可能有喉咙干燥、瘙痒、明显的喉咙痛和吞咽困难。有些病人也会伴有发烧、寒冷和食欲不振。

2、急性扁桃体炎

病原体感染、烟草和酒精过度、有害气体刺激等因素可导致急性扁桃体炎，病原体繁殖到扁桃体，导致严重的咽痛，害怕疼痛，伴有发烧、感冒等全身症状。

3、急性会厌炎

若患者有急性会厌炎，则会导致严重的咽痛和吞咽困难。同时会有明显的咽部异物感和呼吸困难，需要重点关注。