颅内囊肿是否严重主要取决于囊肿的类型、囊肿的部位、囊肿的大小以及是否引起症状等一系列的因素。
因为颅内的一部分囊肿是先天性的，如果囊肿的体积比较小，有可能一部分囊肿会终生保持稳定状态，体积不会增加。这类囊肿并不严重，在长期的临床随访过程中并不引起患者的症状，甚至在患者七八十岁的时候也不会引起症状，这类囊肿是完全可以进行临床随诊观察的，比如通过ct或者磁共振检查，发现的疟疾的蛛网膜囊肿、枕大池的蛛网膜囊肿、松果体的囊肿；这些囊肿通常是保持稳定状态，无需进行临床治疗，更不需要进行手术治疗的。
也有一类囊肿，在这个疾病的进展过程中会逐渐增大，并且引起患者的症状，这类囊肿需要进行神经外科手术干预，比如Rathke类囊肿、桥小脑角区的表皮样囊肿等，这类囊肿常常会逐渐增大，压迫周围的神经和血管结构，使患者出现一系列的症状，这时就需要进行神经外科的手术干预，通过手术的方式切除囊肿，有助于患者的症状缓解和整体病情的控制。这类手术也是神经外科比较微创的手术，是比较安全的，如果患者出现症状，应该及时到神经外科进行治疗。