肾结石前期可能有腰痛、血尿、尿系感染，尿频、尿急，恶心、呕吐等症状。
肾结石常引起腰痛、血尿、尿系感染等症状，肾结石比较小的时候在肾脏的某个盏内不活动，没有特殊的症状或症状轻微的腰部不适，结石在肾盂内活动堵住肾盂出口的时或掉入输尿管内，堵塞后肾盂内尿液不能顺利地经输尿管排出，会产生严重的肾绞痛。疼痛由腰部向会阴部放射性发作，患者坐立不安难以忍受，可能会出现肉眼的血尿，重者可有血块排除。
除腰痛外还伴有恶心、呕吐等消化道的症状，可以出现尿频、尿急等症状，需要到急诊就诊用止痛药治疗。当结石较大，大于两厘米的肾结石一般情况不会有较严重的肾绞痛。因为结石在肾脏内不活动不会引起肾绞痛，多出现腰部的酸胀不适等症状，偶有血尿，在尿常规检查时会发现尿中有红细胞。
无论是肾盂、肾盏内的大结石或小结石，都可能会引起感染。一些结石是感染性的结石，可以出现高热、寒战、血压低、心率快等休克的表现，一旦出现这种迹象要尽快到医院进行治疗。肾结石常引起腰痛、血尿、尿道系感染的症状，疼痛轻重不代表病情的轻重，因此患有结石的患者应该及时到医院就诊评估是否需要治疗。