下午睡觉起来头疼的原因非常多。首先最常见的就是紧张性头疼，因为下午睡觉一般建议午睡时间不能过长，一般脑力劳动者午睡时间在30分钟，体力劳动者午睡时间在40分钟，如果睡的时间过长就会引起头痛、头晕的现象，这是由于睡觉过多以后引起脑血管的变化所导致的。最常见的就是紧张性头疼，是日常生活中最常见的头痛类型，患者主要表现为全头部，或者头部一侧的隐隐作痛、钝痛，这种疼痛一般不影响患者的日常工作与生活，与情绪有关系。如果情绪不佳，压力比较大，就引起头痛的明显的加重，这时候可以服用解热镇痛药物，适当缓解头痛情况，同时改善不良生活方式，比如说睡眠时不要总趴着睡觉等，以便造成其他的情况。
如果头痛非常严重，伴有恶心、呕吐，甚至伴有意识模糊，有可能就是脑血管疾病，尤其患者有高血压、糖尿病等基础疾病病史。出现这种情况，有可能就是脑血管疾病，建议患者及时就诊于神经内科，进行头颅CT检查，以便除外像蛛网膜下腔出血、脑出血造成的剧烈头痛。这是非常可怕的疾病，严重起来会影响患者的生命质量。
还有其他情况造成头疼，比如像神经性的头痛、枕神经痛或耳大神经痛，在睡觉时可能有受凉、吹空调，或者是有凉风，可能会造成神经的受损，而出现剧烈的头痛。这时候患者头痛主要表现的是局部的像火烧、雷击或者是闪电样剧痛，但疼痛时间并不是很长，数秒钟，但会反复发作。这种疼痛一般是神经性的疼痛，这时候可以服用像卡马西平、加巴喷丁以及营养神经的药物，局部进行保暖措施，疼痛自然就会有所缓解。
如果说患者经常会出现头部的一侧的剧烈头痛，尤其是年轻女性，更要考虑可能是偏头痛的存在，尤其有遗传史的患者。这时候要注意根据患者头痛类型，选择像外点咖啡因或者盐酸曲普坦、舒马曲普坦相关药物进行处理。
睡眠要保证但不能睡得太多，要有良好的睡眠卫生习惯，这样才能防止头痛的诱发发生。