预防复杂性肛瘘最主要的因素是保持良好的饮食习惯。其次，可从以下几点来预防：1、多食用一些水果，蔬菜等粗纤维食物，避免食用辛辣刺激食物及饮酒，不要食用油炸食品和油腻的食物。2、保持良好的排便习惯，入厕时间不超过5分钟，上厕所期间不看书玩手机或看报。3、避免长时间站立、久坐和久蹲，避免肛门周围组织受凉。4、多做提肛运动及收缩肛门括约肌运动。5、保持局部皮肤的清洁干燥，坚持每天坐浴。排便前后清洗肛门。无条件者可以用消毒湿巾进行擦拭。禁止使用肥皂或消毒剂清洗肛门，避免肛周皮肤受到强烈的刺激。

预防肛瘘主要从手术方式以及术后护理方面预防。1、如果肛周脓肿切排手术治疗，需要及时的换药，每次换药，一定要有一定要将引流条塞到肛周脓肿的最深处，从而使得其组织至内向外缓慢愈合，避免形成潜在的窦道，继而慢性感染迁延不愈。2、采用所谓的肛周脓肿根治术，也就是在肛周脓肿一次行手术时，找到肛周脓肿的内口，然后一边切排，同时挂线治疗，以减少肛瘘形成2期手术的可能。肛瘘与肛周脓肿其实是同一种疾病的不同分期，都是坐骨直肠肛管周围间隙感染，肛周脓肿的是急性期，肛瘘是慢性期，从临床医学角度来说肛瘘绝大多数是因为肛周脓肿切排手术以后所带来的并发症。

肛瘘是指直肠肛管与周围皮肤相通所形成的瘘。它的特点是以局部反复流脓、疼痛、瘙痒为主要症状，并可触及一条索状的管道通向直肠内部。肛瘘的病因主要是细菌感染，细菌以大肠杆菌、结核杆菌、变形杆菌为主，细菌侵犯的部位是肛隐窝、肛门腺导管、肛门腺体，得了肛瘘以后愈合的几率非常小。手术是肛瘘治疗的主要方法。得了肛瘘首先要保持肛门部的清洁卫生，可以有效的防止肛瘘恶化减少疼痛。肛门部潮湿瘙痒时，注意肛门部的清洁卫生极为重要。如果是肛瘘发痒化脓时，如果外口闭塞可用消毒的针头敲破外口排出脓液，避免脓液向其他部位蔓延。但是最终肛瘘需要手术治疗，治愈的几率非常小。

肛瘘手术的费用，根据低位肛瘘和高位肛瘘，费用是不一样的。低位肛瘘又分门诊手术和住院手术，费用也是不一样。单纯肛瘘手术费用，特别是北京的收费标准，都完全统一，要根据北京市发改委制定的标准统一收费。老百姓常问的肛瘘手术费用，它包括外科医生的手术费用，还包括麻醉医生的麻醉费用和治疗费用。一般门诊手术费用比较低，因为门诊手术室，常常是局部麻醉，麻醉费用低，以单纯的外科医生手术费用占主要，一般不超过两千块钱。但是住院患者的肛瘘费用，又包括了麻醉费用、监护费用，费用就会高出数倍。所以肛瘘手术的费用不能一概而论，具体情况不同，费用不同。各个省的标准也不一样。

肛瘘和痔疮是完全两种性质的疾病，感染原因不同、症状也不同。老百姓觉得肛门有点疼、出水以为是痔疮，把肛瘘误诊为痔疮，实际上不是这样。痔疮属于血管性疾病，以静脉曲张为主，肛瘘是感染性疾病，是大肠杆菌引起的软组织感染，感染后慢慢破溃流脓，从而形成肛瘘。肛瘘与痔疮症状不同，痔疮以便血脱出为主，偶尔会伴有疼痛。而肛瘘以肿块流脓为主，因分泌物太多，引起肛周皮肤病变，有时会伴有瘙痒。此外，肛瘘包块较硬，痔疮因其被血管、软组织、皮肤所覆盖，所以较软，且肛瘘肿胀时会出现疼痛，但痔疮不发作不会疼痛，以出血为主。肛瘘有可能会流血，但与痔疮出血完全不同，痔疮出血为喷射状，肛瘘是破溃流血，因此两种疾病截然不同。