巧克力囊肿是长在卵巢上的，在卵巢上发生了出现了一个囊肿，囊肿里边的囊内的这个液体，不是清亮的，而是那种巧克力色的。囊肿内的有出血，鲜血时间长了以后，就会变成咖啡色变成巧克力色，所以俗称叫巧克力囊肿。一般来讲巧克力囊肿，常见为卵巢的子宫内膜异位症，但是也有少部分是因为卵巢的其他囊肿，伴随着囊内出血也变成了巧克力囊肿。这里面应该强调的是巧克力囊肿只是描述了囊肿内的囊液是巧克力的颜色，但是并不能完全代表是卵巢的子宫内膜异位症。也可能就是一个卵巢的囊肿合并囊内出血，也可能是一个恶性的肿瘤。