巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，因为囊肿的内容物是子宫内膜和陈旧性的血液，样子很像巧克力，所以称为巧克力囊肿。子宫内膜异位生长在卵巢上，异位的内膜与子宫腔内的内膜一样，都会随着卵巢分泌的雌孕激素的变化而变化，而发生坏死脱落流血，但是因为没有排出的通道，只能集聚在卵巢内，久而久之形成囊肿，这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。

多次人工流产就特别容易导致巧克力囊肿疾病出现，女性朋友日常生活里面没有做好避孕措施，就会意外怀孕，如果反复人工流产，那么在进行流产手术的时候，子宫的压力就会发生改变，会导致子宫内膜碎片进入到盆腔，巧克力囊肿就会出现。现在的人思想比较开放，所以性生活也比较紊乱，如果女性在性生活的时候没有注意卫生，像是在月经期间进行性生活，就特别容易让月经血进入到盆腔，导致巧克力囊肿发生，女性朋友一定要小心，在月经期间一定不要进行性生活，在平时也应该注意双方的生殖器官清洁。出现巧克力囊肿还有可能是因为免疫功能受到损害，女性的卵巢部位如果免疫能力不足够，盆腔里面的子宫内膜碎片没有办法及时排出体外，这个时候卵巢的部位就会生长，会造成巧克力囊肿问题出现。

巧克力囊肿会影响月经吗？一般来讲，卵巢的巧克力囊肿不会影响月经，因为月经是由卵巢的雌孕激素，是由整个人体内的有一个生殖内分泌轴来决定月经的。卵巢它主要是分泌雌孕激素，雌孕激素作用在子宫内膜，使子宫内膜出现周期性的变化，出现周期性的脱落，那么在脱落的过程中会有出血，所以我们叫它月经。一般来讲卵巢的巧克力囊肿不会影响卵巢分泌雌孕激素，所以它对月经的影响几乎没有。如果说患者的月经不正常，到医院来检查，可能会是因为其他的原因造成的月经的不调，而并非是因为卵巢的巧克力囊肿。当卵巢巧克力囊肿长得过大，或者出现破裂的时候，在这种情况下，有可能使患者暂时的出现月经的不正常。比如说点滴出血，或者是时间过长，也可能会出现闭经。但总的来讲，卵巢的巧克力囊肿不会影响正常的月经。

巧克力囊肿若明确是子宫内膜异位症导致的，要超声引导下把囊液抽出来，再辅助药物治疗；若为浆液性或粘性囊腺瘤，先将其剥掉，做病理性分析，根据结果对症处理。一、首先看囊肿体积有多大。囊肿直径超过四公分时，应处理。若患者由于不孕症检查到囊肿只有两三个公分时，也应干预。明确是卵巢子宫内膜异位症造成的囊肿，可对囊肿进行抽吸。超声引导下把囊液抽出来，再辅助药物治疗；二、卵巢浆液性或粘性囊腺瘤，里边是咖啡色液体，应把囊肿剥下，进行病理检查。当患者就诊第一次发现卵巢有一个囊肿，高度怀疑是卵巢巧克力囊肿，当直径超过四厘米时，建议患者手术分离，将其剥下来，做病理检查，确认是卵巢子宫内膜异位囊肿后，再进行相应治疗。

卵巢巧克力囊肿不太好治疗，它属于卵巢的子宫内膜异位症。腹腔镜治疗时，把卵巢的巧克力囊肿剔除掉，但是在盆腔内的微小病灶，肉眼观察不到，没有办法把这个小病灶完全清除。在手术之后，很多女性会出现复发的现象。