肾结石可能会导致肾周围脓肿、尿路梗阻，导致肾积水、肾功能不全、无尿、尿毒症。
肾结石是尿路结石的一部分，属于上尿路结石。通常肾结石发生在肾盏，增大后延伸到肾盂。结石过大的，不能排出，在肾盏颈部形成梗阻，会引起肾盏积液积脓，进一步形成肾实质的萎缩，瘢痕的形成，甚至发展为肾周围脓肿。还有的结石在肾盏中慢慢长大，形成鹿角结石或充满肾盏，只能通过手术来取石。
结石易感染，还有少数有恶化的风险。对于小的结石可以通过肾盏一直到达肾盂输尿管，在经过三个生理狭窄处，可以造成急性、完全型和不完全型的尿路梗阻。前者在解除梗阻后不造成肾功能的变化。后者因为是渐进出现，所以会导致肾积水，造成肾实质的受损，最后造成肾功能不全。严重的出现无尿，最后进入尿毒症期，只有通过血液透析来维持生命。出现了肾结石要及时来医院就诊，针对结石的类型加以治疗。