肾结石微创的手术方法有皮肾镜，腹腔镜，腹腔镜肾盂，开放手术。肾结石治疗，需要综合很多的因素制定，会根据患者的状况，结石的大小，现在是否有积水，是否合并了感染来制定详细治疗方案。
对于小的结石没有造成肾积水的，没有症状的这些结石，没有感染的，患者可以多饮水、多运动，口服相关的药物，患者有自行排除的希望。所以患者对于这些小结石可以保守治疗，但是对于有症状性的结石或者结石已经造成了肾积水，或者是结石造成了相关的感染，这时候需要积极治疗。
对于小于两厘米的结石，可以选择体外冲击波碎石，这种方法是在门诊进行，用机器发生超声波，把结石碎掉，碎完之后，有些患者还会有肾绞痛的症状，需要继续的用药对症治疗。
对于体外冲击波治疗失败的，或者不适合做体外冲击波碎石的患者，可以做输尿管软镜的这种碎石治疗。通过尿道进一根镜子之后，听到肾盂发现结石之后用激光把碎掉。对于大于两厘米的结石，患者做经皮肾镜的手术，在肾脏上打一个洞，然后通过镜子进去之后把石头碎掉。对于这种合并输尿管狭窄的患者，可以采用腹腔镜手术或者是开放手术把结石取出，同时处理相关的狭窄，另外还可以通过腹腔镜肾盂切开取石，这种手术可以取出结石，而且还能处理相关的输尿管狭窄。